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栢晖最新推出科研数据处理与作图服务

日期: 2021-11-17
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为更好地给各位新老用户提供一站式科研检测服务,即日起,栢晖隆重推出科研数据处理与作图服务。部分服务项目如下:



一、数据展示与统计分析

小提琴图(violin plots)和箱式图(box plots)

与传统的柱状图相比,基于Origin 2021软件绘制的这两类图可以很好的反应同一组处理下样本的数据分布情况,多用于具有多个重复或采样点的大样本数据,也是目前高水平SCI论文的常见数据展示形式。同时,采用单因素方差分析(one-way ANOVA analysis)检验不同处理间的差异显著性。

栢晖最新推出科研数据处理与作图服务

(1)小提琴图(violin plots)

栢晖最新推出科研数据处理与作图服务

(2)箱式图(box plots)

图引自(1) Zhang et al., 2021. Aridity and NPP constrain contribution of microbial necromass to soil organic carbon in the Qinghai-Tibet alpine grasslands. Soil Biology and Biochemistry.

(2) He et al., 2021. Depth-dependent drivers of soil microbial necromass carbon across Tibetan alpine grasslands. Global Change Biology.


二、影响因子分析

皮尔森相关系数分析(Pearson correlation coefficient)

      也称皮尔森积矩相关系数(Pearson product-moment correlation coefficient) ,是一种线性相关系数,是最常用的一种相关系数。记为r,用来反映两个变量X和Y的线性相关程度,r值介于-1到1之间,绝对值越大表明相关性越强。正负值分别表示变量间正负相关性。

栢晖最新推出科研数据处理与作图服务

图1

方差分解分析(Variance partitioning)

      将所有因素共有的方差分割,然后用于量化每一组因素的独特贡献。

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图2

结构方程模型(Structural equation model)

      用于评价目标变量与影响因子之间的直接和间接关系。这种方法可以划分一个变量对另一个变量可能产生的直接和间接影响,因此有助于探索自然生态系统中的复杂关系。

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图3

随机森林分析(Random forest analysis)

      用于分析多个因子对目标变量的相对重要性。

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图4

图引自(1) Chen et al., 2020. Regulation of priming effect by soil organic matter stability over a broad geographic scale. Narure Communications.

(2) Chen et al., 2021. Soil carbon persistence governed by plant input and mineral protection at regional and global scales. Ecology Letters.

(3) Jeewani et al., 2021. Abiotic and biotic regulation on carbon mineralization and stabilization in paddy soils along iron oxide gradients. Soil Biology and Biochemistry.

以上四种分析方法是目前常用的用来解析目标变量与影响(驱动)因子的直接和间接关系的主流分析方法,也是高水平SCI期刊的常见数据分析方法。此外,栢晖将根据您的具体需求,量身打造完美数据分析和图片展示,其他常见数据分析和作图均可实现,欢迎致电:18682730999 / 028-85253068咨询详情。



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    2025 - 01 - 09
    文献解读原名:Decadal application of mineral fertilizers alters the molecular composition and origins of organic matter in particulate and mineral-associated fractions译名:十年的矿质施肥改变颗粒态和矿物结合态组分有机质的分子组成和来源期刊:SBBIF:9.8发表时间:2023.07第一作者:Zhichao Zou摘要背景:长期矿质施肥对土壤有机质(SOM)的数量、质量和稳定性的影响仍不明确。方法:通过结合四种生物标志物(自由与结合态脂类、木质素酚和氨基糖),研究中国北方农田在10年矿质施肥下(400 kg N ha−1 yr−1, 120 kg P ha−1 yr−1 和 50 kg K ha−1 yr−1)的SOM的分子组成、分解和来源。我们关注于两个差异化的SOM组分:颗粒态有机质(POM)和矿质结合态有机质(MAOM)。结果:尽管施肥对全土SOC的影响有限,但导致MAOM中SOC增加23%,并且改变了其组成和来源。施肥使POM中植物源的萜类化合物增加46%,MAOM中长链脂类(≥20)增加116%,但是降低了POM中54%的短链脂类(结论:矿质施肥通过改变温带农业生态系统中矿物-有机复合体的分子组成和固存,增加SOM的稳定性和持久性。研究背景SOM能够维持土壤肥力、促进土壤水分存留和有机碳(SOC)固存,对农业生态系统的功能的发挥至关重要。在典型的农田,大量矿质肥料的输入增加了作物生产力,导致大量的碳(C)通过残体、根系及其分泌物进入土壤,随后改变了SOM周转。然而,我们对SOC稳定和固存对营养施肥的响应方向和程度的基础理解仍然不明确。之前的研究报道了农业生态系统中施肥管理导致更高、中性以及甚至更低的SOC水平。在集...
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    2025 - 01 - 02
    文献解读原名:Temperature-dependent soil storage: Changes in microbial viability and respiration in semiarid grasslands译名:随温度变化的土壤储存:半干旱草原微生物活力和呼吸作用的变化期刊:Soil Biology and BiochemistryIF:9.8线上发表日期:2024年12月发表日期:2025年3月通讯作者:田建卿(中国科学院植物研究所)亮点(1)相比于-20℃,在4℃下储存土壤细胞的存活率更高。(2)在 4 °C 下温和解冻 3 天可优化冻土中的细胞活力。(3)土壤呼吸对储存的响应取决于土壤类型。背景土壤微生物是生物地球化学循环的关键引擎,也是土壤有机碳 (SOC) 分解和稳定的关键驱动因素。理想情况下,研究人员应在取样后立即对新鲜土壤进行大多数微生物活动和微生物介导的土壤生物地球化学分析,然而,由于实际限制,在低温下储存土壤是土壤微生物学研究中的常见做法,可能会影响微生物活力和微生物介导的呼吸作用,几十年来,不适当的储存条件导致了已发表的研究中相互矛盾的结论。目前对储存过程中活微生物参数的变化和微生物介导的呼吸仍然缺乏了解。材料与方法(1)于2022年8月和2023年5月在从内蒙古草原生态系统研究站(IMGERS;116◦42′E,北纬43°38′,海拔约1260米)。中国内蒙古自治区采集了4种类型的土壤,包括大针茅(S.grandis)、羊草(L.chinensis)、西林河流域草甸(湿地)和浑善达克沙地(沙质)土壤。之后将4种类型的土壤样本分别在4℃和 -20℃下储存 0、5、40 和210天。对于在-20℃下保存的土壤,作者采用了两种解冻方法:室温下直接解冻和4 ℃下温和解冻(gentle thaw...
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    2024 - 12 - 06
    # 栢晖 #—特色检测指标—土壤、植物酶活检测氨基糖、PLFA及其同位素、磷组分木质素酚、CUE、有机氮组分、有机酸氨基酸、微生物量碳氮磷、同位素等苯多羧酸、红外光谱、微生物多样性等其他土壤、植物、水体等常规检测指标均可测定欢迎联系下方相关工作人员详细沟通
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    2024 - 11 - 29
    文献解读原名:Rhizosphere as a hotspot for microbial necromass depositioninto the soil carbon pool译名:根际是微生物残体进入土壤碳库的热点区期刊:Journal of EcologyIF: 5.3发表日期:2024.11.15第一作者:汪其同背景森林土壤是陆地生态系统最大的有机碳(SOC)库,高效发挥森林土壤碳汇功能是实现“双碳”战略目标的重要途径之一。相应地,科学认识森林土壤固碳过程与调控机制已成为当前森林生态学、土壤学领域重要的前沿基础科学问题与林业碳汇功能适应性管理的核心现实需求。近年来不断涌现的证据表明,微生物通过合成代谢而迭代积累的微生物残体很大程度上主导了SOC的长期积累和固持。其中,由于根源C持续输入在根系周围的根际微域形成了一个独特而又典型的微生物热点区,并伴随着更快的微生物生长和更强的微生物代谢活性,进而导致根际区微生物残体对长期SOC积累贡献能力比非根际区更为突出和明显。然而,目前大多研究通常将根际和非根际土壤视为一个均质有机体,而缺乏针对根际区SOC形成过程与稳定性机制的专一性试验研究,导致根际区土壤碳动态过程及其生态重要性在很大程度上未被探索和了解,已成为森林土壤碳汇功能变化认知最少且极为薄弱的关键环节之一。基于此,中国科学院成都生物研究所尹华军研究团队通过系统收集青藏高原典型高寒针叶林39个样点的根际和非根际土壤样品(图1),量化了根际和非根际土壤中有机碳和氨基糖的浓度,并通过计算根际相对于非根际土壤中增加的氨基糖与增加的有机碳的比例(RAS/SOC),评估了微生物残体对根际SOC积累的贡献程度。同时测定了根际土壤养分浓度和微生物生理性状,以揭示多变环境下根际微生物残体对SOC积累贡献的潜在微生物调控机制。图1  39个高寒针叶林采样点分布图我们假设:(1...
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案例名称: 孵化中心
说明: 栢晖生物科技有限公司项目孵化中心成立于2015.06.01日,研发领域涉及生物试剂耗材、仪器、新产品开发及各生物科技服务类项目等。自成立以来,陆续吸引了大批专家教授加盟合作,并与全国数十家高校及知名企业建立了良好的合作关系。中心共有博士及以上学位骨干人员10人,专门负责公司新产品研发等工作,已成功研发出无线温度监控器及NO检测试剂盒等产品(详情见成功案例),另有细胞分选仪等三个项目正在积极孵化当中。
2017 - 05 - 31
案例名称: 孵化中心流程
说明:
2017 - 07 - 17
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